À l’avenir, un peu de salive suffira peut-être à détecter le cancer naissant. Des chercheurs de l'Université de Göteborg ont développé une méthode efficace pour déchiffrer les modifications des molécules de sucre dans les cellules cancéreuses. Les glycanes sont des structures de molécules de sucre liées aux protéines des cellules. La structure du glycane détermine la fonction de la protéine. On sait depuis longtemps que les changements dans la structure des glycanes peuvent prédire une inflammation ou une maladie dans le corps.
Aujourd'hui, des chercheurs de l'Université de Göteborg ont développé un moyen de distinguer différents types de changements structurels, ce qui peut fournir une réponse précise aux changements spécifiques à une maladie.
"Nous avons analysé les données d'environ 220 patients présentant 11 diagnostics de cancer différents et avons découvert des différences dans la sous-structure des glycanes selon les types de cancer", a déclaré Daniel Bojar, maître de conférences associé en bioinformatique à l'Université de Göteborg et premier auteur de l'étude publiée dans Cell Reports Methods. "Nous avons pu établir ces liens en laissant notre méthode nouvellement développée traiter de grandes quantités de données à l'aide de l'intelligence artificielle."
D'autres groupes de recherche étudient la sous-structure des sucres, à la recherche de soi-disant biomarqueurs pour caractériser le problème. Cela implique souvent d’utiliser la spectrométrie de masse pour effectuer des tests statistiques afin de déterminer si les niveaux de sucres individuels sont significativement plus élevés ou plus faibles chez les patients atteints de cancer. La sensibilité de ces tests est trop faible et peu fiable car les différents sucres sont structurellement liés et donc non indépendants les uns des autres.
L'équipe de recherche de Daniel-Boyard a utilisé une nouvelle méthode faisant appel à l'intelligence artificielle qui prend en compte ces problèmes et est capable de trouver des modèles dans des ensembles de données là où d'autres méthodes échouent.
"Nous pouvons faire confiance à nos résultats, ils sont statistiquement significatifs. Si nous savons ce que nous cherchons, il est plus facile de trouver les bons résultats. Désormais, nous allons utiliser ces biomarqueurs pour développer des tests", explique Daniel Bojar.
Cet automne, son groupe de recherche a reçu 4 millions de couronnes suédoises de la Fondation Lundberg pour acheter un spectromètre de masse de pointe. L’instrument servira de plateforme d’intelligence artificielle pour soutenir les chercheurs qui étudient les sucres, tels que ceux trouvés dans les échantillons de cancer du poumon. L’idée est de détecter le cancer plus tôt, améliorant ainsi les chances de guérison.
"Nous voulons développer un test fiable et rapide pour détecter le cancer et le type de cancer dans un échantillon de sang ou de salive. Je pense que nous pourrions être en mesure de réaliser des tests cliniques sur des échantillons humains dans 4 à 5 ans", a déclaré Daniel-Boyar. "
Source compilée : ScitechDaily