Avant le lancement du 2 février, les développeurs avaient peu de possibilités de développer des applications à l'aide du matériel Vision Pro d'Apple, ce qui entraînait un déploiement lent des applications natives, qui prenait environ 11 jours pour atteindre 1 000. Avant la sortie du Vision Pro d'Apple, certaines inquiétudes existaient quant à l'ampleur de l'expérience native lorsqu'il serait rendu public. Les décomptes préliminaires effectués en janvier ont estimé ce nombre à environ 150, mais le 2 février, ce nombre a rapidement augmenté pour atteindre 600.
Le 13 février, Greg Joswiak, vice-président senior du marketing d'Apple, a révélé que le nombre d'applications natives visionOS dépassait désormais le millier. Le nombre d’applications iPhone et iPad compatibles a également augmenté pour atteindre plus de 1,5 million.
Les applications natives visionOS sont conçues en tenant compte du système d'exploitation. Ils ont tendance à avoir de grandes cibles pour le suivi oculaire, des cadres en forme de verre et des menus interactifs entourant les fenêtres appelés widgets.
Les applications compatibles s'exécutent dans une fenêtre 2D plate et peuvent être affichées en orientation portrait ou paysage. Ils apparaissent exactement de la même manière sur un iPad ou un iPhone.
Le nombre limité d'applications ou de jeux disponibles signifie que dans visionOS 1.0, la fonctionnalité de l'App Store est très rudimentaire. Il existe très peu de catégories et il est très difficile de trouver une application qui ne fait pas partie de la catégorie Accueil.
Apple VisionPro et visionOS en sont encore à leurs débuts. Étant donné que le produit n'est disponible qu'aux États-Unis, de nombreuses applications populaires risquent de ne pas être mises à jour vers visionOS avant le lancement mondial du matériel.