C. difficile peut provenir non pas d’une transmission externe mais du patient infecté lui-même. Le personnel hospitalier travaille dur pour protéger les patients contre les infections pendant leur séjour. Ils s'efforcent de prévenir l'infection grâce à des pratiques allant de l'hygiène des mains à l'utilisation de salles d'isolement et à des procédures de nettoyage strictes. Cependant, même avec ces mesures en place, des infections nosocomiales surviennent encore, la plus courante étant causée par Clostridium difficile (C.diff), responsable de près de 500 000 infections chaque année aux États-Unis.
Les résultats surprenants d’une nouvelle étude publiée dans Nature Medicine suggèrent que le fardeau de l’infection à Clostridium difficile pourrait ne pas être un problème de transmission nosocomiale mais plutôt le résultat de caractéristiques associées aux patients eux-mêmes.
L'équipe de recherche est dirigée par le Dr Evan Snitkin. Vincent Young, MD, des départements de microbiologie et d'immunologie et de médecine interne/maladies infectieuses de la faculté de médecine de l'Université du Michigan, et Mary Hayden, MD, du Rush University Medical Center, ont utilisé des recherches épidémiologiques en cours axées sur les infections nosocomiales pour leur permettre d'analyser des échantillons de selles quotidiens de chaque patient de l'unité de soins intensifs du Rush University Medical Center sur une période de neuf mois.
Arianna Miles-Jay, chercheuse postdoctorale dans le laboratoire du Dr Snitkin, a analysé plus de 1 100 patients dans le cadre de l'étude et a découvert qu'un peu plus de 9 % étaient colonisés par C. difficile. À l’aide du séquençage du génome entier de 425 souches de C. difficile isolées de près de 4 000 échantillons de selles à l’Université du Michigan, elle a comparé les souches entre elles pour analyser la transmission.
"En cultivant systématiquement des échantillons de chaque patient, nous pensions pouvoir comprendre comment se produit la transmission. Étonnamment, sur la base de la génomique, le taux de transmission était très faible."
Essentiellement, il existe peu de preuves que les souches de C. difficile sont les mêmes d’un patient à l’autre, c’est-à-dire acquises en milieu hospitalier. En fait, il n’y a eu que six transmissions fondées sur le génome au cours de la période d’étude. À l’inverse, les personnes déjà colonisées courent un plus grand risque d’être infectées.
"Il se passe chez ces patients quelque chose que nous ne comprenons toujours pas et qui provoque la transformation du C. difficile dans l'intestin en micro-organismes provoquant la diarrhée et d'autres complications infectieuses", a déclaré Snitkin.
Cela ne signifie pas qu'aucune mesure de prévention des infections dans les hôpitaux n'est nécessaire, a noté Hayden. En fait, les mesures prises dans l'unité de soins intensifs Rush au moment de l'étude - respect élevé de l'hygiène des mains par le personnel médical, désinfection systématique de l'environnement avec des anti-C. L’étude actuelle met en évidence qu’il reste encore beaucoup à faire pour identifier les patients colonisés et tenter de prévenir leur infection.
D’où vient le C. difficile ? "Ils sont tout autour de nous et C. difficile produit des spores très résistantes aux facteurs de stress environnementaux, notamment l'exposition à l'oxygène et la déshydratation... Par exemple, elles ne sont pas affectées par le désinfectant pour les mains à base d'alcool."
Cependant, seulement environ 5 % de la population non soignée a C. difficile dans ses intestins – et cela ne pose généralement aucun problème.
"Nous devons trouver des moyens d'empêcher les patients de développer des infections lorsque nous leur donnons une alimentation par sonde, des antibiotiques, des inhibiteurs de la pompe à protons - qui peuvent tous rendre les gens sensibles à l'infection à C. difficile, ce qui peut entraîner des lésions intestinales ou pire", a déclaré Yang.
L’équipe espère ensuite s’appuyer sur ses travaux sur l’utilisation de l’intelligence artificielle. Les modèles prédisent les patients à risque d’infection à C. difficile afin d’identifier les patients susceptibles d’être colonisés et qui pourraient bénéficier d’une intervention plus ciblée.
"Des ressources importantes sont consacrées à l'amélioration de la prévention de la propagation des infections, et il existe un soutien croissant pour orienter certaines de ces ressources vers l'optimisation de l'utilisation des antibiotiques et l'identification d'autres déclencheurs qui conduisent les patients à héberger C. difficile et d'autres bactéries", a déclaré Snitkin.